В соответствии с внесенными изменениями установлено, в частности, что председатель ФОМС (а не директор, как это было установлено ранее) назначается на должность и освобождается от должности Правительством РФ по предложению Министра здравоохранения и социального развития РФ. Министр здравоохранения и социального развития РФ назначает на должность и освобождает от должности заместителей председателя ФОМС, утверждает административные регламенты исполнения фондом государственных функций и предоставления государственных услуг, а также порядок организации проверок деятельности фонда; Министр здравоохранения и социального развития РФ является по должности председателем правления ФОМС. Установлено также, в частности, что проект бюджета ФОМС на очередной финансовый год и плановый период и проект отчета об исполнении бюджета ФОМС представляет, соответственно, в Минздравсоцразвития РФ, а не в Правительство РФ, как это было установлено ранее.